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中国科学家领衔构建完成黄瓜全基因组遗传变异图谱

2013年10月21日 21:50 来源:新华网 参与互动(0)

  中国农业科学院21日发布消息称,由该院蔬菜花卉研究所研究员黄三文领衔的国际黄瓜基因组研究,对115个黄瓜品系进行了深度重测序,并构建了包含360多万个位点的全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。

  20日,国际权威学术期刊《自然―遗传学》在线发表了相关研究成果。据黄三文介绍,黄瓜源自喜马拉雅山脉南麓,本是印度境内土生土长的植物。野生黄瓜果实和植株都比较矮小,果实极苦,原本在印度被作为草药使用。经过人类的驯化,黄瓜果实和叶片都变大了,果实也失去了苦味,由一种草药变成了品种多样的可口蔬菜,如今在世界范围内广泛种植。在科研上,黄瓜常被用来作为研究植物性别决定、维管束形成的重要模式系统。

  科研团队挑选的115个黄瓜品系分为印度类群、欧亚类群、东亚类群和西双版纳类群等4大类,其中印度类群主要来自于野生变种,而其余3个品种均来自栽培变种。通过比较分析发现,印度类群遗传多样性远远超过其他3个类群。这一结果证实了印度是黄瓜的发源地,也意味着野生资源中尚有很多待挖掘的基因资源。

  研究发现,黄瓜基因组中有100多个区域受到了驯化选择,包含2000多个基因。其中7个区域包括控制叶片和果实大小的基因,果实失去苦味的关键基因已经明确地定位在染色体5上包含67个基因的一个区域里,为下一步克隆这一重要蔬菜驯化基因打下了基础。

  研究人员还发现了西双版纳黄瓜一个特有的突变。该突变导致西双版纳黄瓜在果实成熟期不能降解β-胡萝卜素,使得其具有特有的橙色果肉,而不是大部分黄瓜所呈现的白色或浅绿色果肉颜色。这一发现不仅为培育营养价值更高的黄瓜品种提供了分子育种工具,也为通过变异组快速挖掘重要性状基因提供了新思路。(记者董峻)

【编辑:朱峰】

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