据悉，在麦哲伦流的端部，分布着两个围绕银河系运行的矮星系，即大麦哲伦星云和小麦哲伦星云。当1970年代天文学家使用射电望远镜发现了麦哲伦流时，他们就怀疑这些气体是否来自于大小麦哲伦星云其中之一或者两者全部。而哈勃望远镜的新观测揭示，麦哲伦流的大部分气体来自于约20亿年前的小麦哲伦星云，而第二个起源则是来自于最近的大麦哲伦星云。