1931年9月18日，日本制造了震惊世界的“九·一八事变”，而在这场国耻家仇当中，冯庸和他的大学却也在战火中经历了一段波折却又传奇的历史。
在平静中度过了“九·一八”
1931年的暑假结束后，冯庸大学迎来了一个鼎盛的发展时期，不但入学的中国人多了，更有六位日本留学生前来冯庸大学留学。学生多了，教职员工也势必要增加，但当时学校的收入已经难以维持学校的正常支出，而当时冯家唯一的家产，也只剩下了为冯庸母亲养老而留下的两处丝房。看到儿子开办的学校欣欣向荣地发展，冯老夫人也感到欣喜不已，现在看到学校山穷水尽，老夫人毅然决然地把两处丝房变卖，投资到了学校之中。
解决了资金问题，学校重新步入正轨，开学之后的冯庸大学一切都在按部就班地继续着。然而，没有人想到，一切都在9月18日这一天发生了变化。
1931年9月19日，本应是平凡的一天，但这一天的清晨，前往市内接教授来校上课的校车却没有按时回到学校，学生们也没有慌乱，自行温习功课或者在校园里散步。然而，此时一名警卫却走到刘毅夫(冯庸大学学生，参见本报之前报道)身旁，小声地对他说：“听说日本鬼子占领了沈阳城！ ”
警卫的声音虽小，却犹如晴天惊雷一般让刘毅夫感到震惊不已。为了证实警卫消息的真实性，刘毅夫特意爬上了学校内的旗杆，瞭望沈阳城内的情况，但此时的沈阳城既无烟火也听不到枪声炮响，丝毫没有打仗的迹象。刘毅夫稍微安下心，认为警卫的消息一定是错误的。
然而，没过多长时间，前往市内接教授的校车却空车而回，下车的司机对学生讲：“车一开到满铁的桥洞，武装站岗的日本兵就不许行人和车辆前进了，当我把车停在路旁，下车一打听，才有人哭兮兮地告诉我，昨天晚上鬼子兵突然攻入北大营，然后又占领了沈阳城。 ”
为了印证消息的准确性，冯庸亲自驾车前往火车站一探究竟。冯庸从沈阳站带回的消息证实，日本人这一次动了真格的，蒋介石的不抵抗政策也使得日本人未进行过多的战斗便轻松占领了沈阳城。
冯庸被捕密嘱学生速撤北平
看到沈阳沦陷，爱国心切的冯庸暗自做出决定，准备带领学生武装离校，组建抗日义勇军重新打回来。然而，当他把这样的想法告诉给周围的几个关键人物之后，消息却传到了日本人的耳中。冯庸大学在之前早就已经是日本人的眼中钉、肉中刺，再加上这一次冯庸要组建义勇军的消息传到了日本人的耳中，他们自然不会放过冯庸。
9月21日，日本鬼子终于将矛头对准了冯庸大学，这一天他们将军队开进了冯庸大学，将正在校长办公室的冯庸抓捕了起来，带到了沈阳城内。日本人虽然逮捕了冯庸，但是却并没有急于杀死他，因为日本人还有别的目的，他们希望冯庸能够出面组织一个傀儡政权，代替日本人维持统治。冯庸自然不会答应这样的要求，死也不答应，但日本人当时仍然抱着再争取一下的想法，暂时未对冯庸下黑手。
此时，冯庸大学却陷入了群龙无首的状态，学生们一时间不知如何是好。为了设法营救冯庸，当时的教育长郭甄泰找到学生王友庆、刘毅夫、李少铎等人，准备前往日本宪兵队进行谈判，设法营救被捕的冯庸。郭甄泰早年曾留学日本，懂得日语，一路上靠着日语和日本人打交道省了不少时间。
来到日本宪兵队，由于尚未打消让冯庸组织傀儡政权的想法，日本人对冯庸还是比较客气的，也答应了学生们要见冯庸的请求。然而，冯庸在看到几人之后，却非常平静地挥了挥手，告诉几人：“你们快回去吧！ ”王友庆和刘毅夫等人都感到莫名其妙。
当告别冯庸之后，李少铎却对开车的王友庆小声说道：“车开快点，越快越好。 ”很快，几人驾车离开沈阳城，在开出很远之后，车子才逐渐慢了下来。此时，李少铎伸出右手，向众人展示了一张纸条，这是冯庸在与李少铎握手时交给他的，上面仅有潦草的几个字：“冯大师生速到北平。 ”然而，这潦草的几个字却是校长的命令，关系到学校师生的命运。
回到学校传达了校长的命令之后，学生们开始四散逃亡，准备前往北平。
13天牢狱冯庸一生中最大耻辱
日本人对于冯庸，有着一种难以言表的感情，一方面他们希望冯庸这样在东北有着巨大影响力的人出面，组织傀儡政权统治东北，一方面他们却对冯庸组织抗日一事感到不满，爱恨交加。在冯庸被关押期间，日本人曾经不止一次地劝说冯庸接受他们的请求，均遭到冯庸的拒绝，而这也让日本人起了杀机。
在冯庸被捕之后，很多人都开始为解救冯庸积极地活动着，之前一直坚持来冯庸大学训练学生田径项目的冈部平太出现了，他联系日本的各种关系，在冯庸被逮捕期间，往返于沈阳和大连十数次，最终找到了当时日本天皇的亲弟弟秩父宫亲王，由他出面代表天皇向关东军施压。关东军即便再有势力，总是要给天皇面子的，他们最终答应释放冯庸，但是却为冯庸留下了三条规定，要求他不准组织抗日活动，不准离开沈阳，不准进行任何抗日宣传。冯庸答应这些条件后，终于在被逮捕13天后被释放了。
后来，冯庸在写给冈部平太的信中曾经写道：“‘九·一八事变’后，我遭到日本宪兵队逮捕囚禁，过了13天的罪犯生活，这是我一生最刺心的侮辱。 ”然而，被释放的冯庸如果继续留在沈阳，他也将继续过着被监视的生活，这必然会让他备受煎熬。除此之外，冈部平太也认为冯庸留在沈阳已经不再安全，有可能某一天会遭到关东军的暗杀，应该及早撤离。
因此，在10月3日从日本宪兵队释放之后，冈部平太连夜安排车辆带着冯庸逃往大连，暂时躲避数日。 10月17日，在冈部平太的安排下，冯庸化名龙兢，并且持所有从日本出国的相关证件，由大连踏上了飞往东京的飞机，在下飞机之后便又踏上了驶往欧洲的一趟轮船，准备流亡欧洲。
10月26日，冯庸所在的轮船停靠在上海进行补给。此时，冯庸站在船头思绪万千，他知道一旦轮船驶离上海，他将很难再回到祖国的土地上。想到这，他改变了主意，从轮船上溜了下来，潜回到了上海。
流亡大学辗转在北平开学
27日，冯庸抵达南京，面见蒋介石。蒋介石对于冯庸的忠贞不二，不接受日本人的引诱非常赞赏。蒋介石问冯庸：“你想做什么？ ”冯庸坚决地回答道：“我仍然要办大学！ ”蒋介石听到这样的回答，便允诺将北平西直门里的陆军大学旧址送给了冯庸，让其在那里复校，并且送给冯庸五万大洋的奖助金。 28日，冯庸从南京驾驶飞机回到北平，在北平重新建立起冯庸大学。
此时，冯大流亡的学生已经在当时的师大二院集结了起来，准备组建义勇军重新打回东北。冯庸回到北平之后，开始组织同学进行抗日宣传，他让几名学生写好抗日标语，在各大学门前进行宣传。然而，此时的北平却并没有受东北沦陷所影响，舞场内依然是灯红酒绿，见此状，冯庸带领学生们不分昼夜地奔走、呼号、宣传，终于使陈腐的北平出现了共赴国难的朝气。
