深圳国家基因库发起国际“千种鱼转录组计划”
中新社深圳11月19日电 (记者 郑小红)深圳国家基因库19日宣布,一项具有重要开创性意义的国际“千种鱼转录组计划”(FishT1K)启动。该项目旨在解密鱼类的起源、进化、生殖、发育、性别调控和免疫等问题,应对鱼类育种、疾病防控、海洋食品安全和生物多样性保护等带来的诸多挑战。
相对于其他鱼类转录组研究,千种鱼转录组计划规模之大、学科交叉之广、综合性之强,在全球范围内尚属首例。该项目产出的所有数据将通过国家基因库进行公开,以保证科学家可以实时掌握鱼类研究动态及RNA-seq测序技术的最新应用。
鱼类是所有脊椎动物中种类最多的群体。据估计,全球鱼类约有3万余种。很多鱼类具有极大的经济价值和医学价值,同时在生态保护中起着重要的作用,是自然界生物多样性的一个重要组成部分,但目前仅有约10种鱼类的基因组被公开报道。而美国国立生物技术信息中心公共数据库中,也仅有80多种鱼类转录组数据。“鱼类组学数据的缺乏激发我们去建立一个大规模的鱼类转录组数据库。”深圳国家基因库负责人张勇指出。
国家基因库海洋分库负责人、该项目带头人孙颖认为:“T1K项目将建立首个专门针对鱼类组学研究的全球性合作网络,以及促进鱼类资源医用价值的挖掘、经济和生态价值的开发,海洋食品安全和生物多样性保护等问题的解决。”
该项目已建立了包括国家基因库、深圳华大基因研究院、美国乔治华盛顿大学、新加坡分子与细胞生物学研究所、美国国家自然历史博物馆、加拿大圭尔夫大学、中国水产科学研究院黄海水产研究所、昆明动物研究所、南海海洋研究所、中山大学等多家单位组成的国际一流的科研团队,计划在未来3-5年内完成约1000种鱼类转录组的测序、组装工作,并构建高质量的鱼类转录组数据信息平台。(完)